能维持身体生命活动甚而能制造身体的心识，依大乘唯识学之说，应是具有执持根身作用的阿陀那识，即被第七末那识恒执为内自我的阿赖耶识。此识不仅在意识底层默默地进行着处理心识活动信息（种子）的工作，而且在默默地进行着处理有关生理活动信息的工作。有如一台超级电脑，为色身得“活”、具有生命、按一定规则新陈代谢的主管者和动力源。大乘如来藏系学说则认为真如心乃生理活动之本。《坛经·定慧品》云：“真如自性起念，非眼耳鼻舌能念，真如有性，所以起念，真如若无，眼耳色声当时即坏。”谓本然如是的真如自性，为心理、生理活动的根本。真如自性，又称“本心”、“心体”，有释为阿赖耶识者，有释为第九天垢识者。依万有唯一心的真心现起论，身、心皆是一真如心的显现，同一体性，故云不二。《楞严经》云：“汝身汝心，皆是妙明真精妙心中所现物。”

在佛学看来，众生禀受受的身形相貌、生理素质，是其前世所造业感招的异熟果，终归为自己所塑造。经论中说天生长相好，人见爱乐，是前世忍辱、柔和、谦逊有礼的业报，所谓“今生人见欢喜者，前世见人欢喜故。”相貌丑陋，人见不喜，则是前世多嗔恨、骄慢无礼的业报。《正法念处经·观天品》云：“心清净故，血则清净，血清净故，颜色清净。”谓心灵之纯净，能通过血液的净化而使人容貌端正，脸色白净光润。反之，心灵污秽肮脏，能使人容貌丑恶，面色晦暗。按佛学业报因果法则，众生念念造业，念念受报，业报并不仅限于在来世方成熟的异熟果，今生现世的心理和行为，完全有可能形成影响今生现前形貌的现报。相貌，在某种意义上说，是表情的凝固。如经常愁眉不展，天长日久会凝固成一副苦相；经常喜笑颜开，天长日久会凝固成一副欢喜相；经常动肝火发脾气，天长日久会凝固成一副凶相。吸烟、皱眉、撇嘴、眯眼等不良习惯也有损面相。美国前总统林肯曾说：“四十岁以后，每个人得对自己的相貌负责。”现在有人认为，每个人应从四岁起便对自己的相貌负责。佛学说，行善积德，净化心灵，能使人的相貌变得庄严端正，亦有人应对自己的相貌负责之意。佛教史传中，不乏高僧大德因修行而使相貌变得庄严祥和的范例。

佛学还以禅定修习中由自控意念而导致的呼吸、脉博、心跳等的变化，证明心理可影响、反馈于生理，生理依赖于心理，甚而可以说是为心理服务的。在禅定修习中，当心从散乱动荡渐渐寂定时，呼吸亦逐渐减慢。若进入一念不生、湛如止水明镜的第四禅，呼吸亦随心波之止息而止息。《成实论》卷十六云：“随心细时喘息亦细，四禅心不动故，出入息灭。”同论卷十八：息“若有心则有，无心便针，故知由心。又随心差别，粗心则短，细心则长。”呼吸随心念的微细寂定而变细变缓，在今日已被百千万人的气功经验所证明，极易获得实验证据佛学还说禅定若进一步深入，达到无所有处深定时，脉博、心跳迹停止，煖、寿不灭，生命活动的节奏变得极为缓慢，然非停止、死亡。实际上，呼吸、脉博、心跳随心理活动而变化一事，常人皆不难体察；当心情紧张、慌张、惊恐时，呼吸、脉博、心跳都会明显加快，还会连带引起脸色的变化乃至小便失禁等生理反应。熟睡或被催眠时，呼吸、脉博会减伤害脏腑而致病，佛学也说心理失调可导致生理疾病。《佛学医经》所举引起身中四百四病的十种主要病因中，忧愁、嗔恚二因属心理病因。淫佚也与心理相关。《摩诃止观》卷八说由烦恼所起的杀、盗、五根病。西方医学发展到现代心身医学的建立，才认识到心理因素可导致生理疾病，将心理因素在疾病的发生和演变中起着主导作用的躯体疾病称为“心身病”或“心理生理疾患”，这类病包括过敏性结肠炎、神经性厌食、高血压、心脏病、肿瘤、消化性溃疡、支气管哮喘、便秘、皮肤病、过敏等数十百种，通过放松、笑、谈心等心理治疗，可以治愈许多心身病。

关于心理对生理的作用，现代科学作了很多研究。20世纪30年代，科学家受英国伦敦一脾气暴躁妇女的浮汁竟能毒死其婴孩的启示，对人呼出的气进行化学分析，发现人忧郁伤心时的分泌物能使某种液体产生有害于健康的白色沉淀物；盛怒时的分泌物则出现粉红色的沉淀物，其毒性足以杀死耗3公里长跑所消耗的体能；而心平气和时呵出的气在试管中只生成蒸气水滴，无沉淀物。心理学研究的成果表明，经常说谎可造成中枢神经系统功能紊乱，进而影响内分泌和免疫功能，导致焦虑、压抑、胃肠粘膜血管痉挛、食欲减退等症状；愤怒、沮丧、恐惧、激动、悲痛等情绪，通过下丘脑、脑下垂体植物性神经系统，能引起身体器官功能的不良变化。如在焦虑、愤怒、怨恨时胃粘膜充血，胃酸分泌增多，导致胃溃疡；恐惧、悲伤时胃粘膜变白，胃酸停止分泌，引起消化不良。巴西名医阿尼塞托·马丁研究贪官的健康状况10年，发现这些人中百分之六十的人常患各种疾病，百分之七十的人常服镇静剂，说明他们常处于紧张、焦虑、不安中。美国精神病专家雷神德·威廉斯研究发现，易怒和愤世嫉俗的人比沉着冷静、充满善意的人死亡的可能性要高出四倍。乐观、开朗、友善、坦直、诚实、勤恳、乐于助人、具正义感等佛学认为善的性情，被心理学家们公认为有益于身体健康、延年益寿。对禅定、气功、瑜伽者脑电、心电的测量研究表明：当由自调其心而进入禅定或“气功态”时，具有组织新功能态能力的额叶脑电波随功夫的深入而趋向高度有序化，通常状态下主要在大脑皮层枕区的a波转向额区，通常状态下的左脑优势转向右脑优势，非对称结构转向镶嵌交叉的“大脑太极图”对称图像，使大脑处于一种与睡眠、清醒皆不同的全脑共振、特殊兴奋状态，不仅有改善血液循环、微循环、降低耗氧率、提高免疫功能等良性生理效益，还为提高智能提供了生理基础。这些研究成果，为佛学的心身不二论提供了有力的证据。

现代精神分析学之父弗洛伊德认为，因道德观念等而被压抑进无意识中的本能冲动，特别是性的本能冲动，“在神经的和心理的疾病中，起着一种极不寻常的巨大作用。”发掘出埋藏在精神病患者无意识深处的病源，在临床治疗上取得不少成功。其实，心理因素还能通过无意识的储积导致心身病。当代心身医学一般认为，心理病因主要通过情绪，影响中枢神经、内分泌、免疫三大系统的失调。从而引起躯体疾病。有学者认为，人的意识系统和生理系统为“全息对应”关系，意识分六个层次，第五层次潜意识主要调控生理，“情绪是它制造出来的心理画图，表情是它制造出来的生理画图。”总之，疾病是人的潜意识制造出来的。此说显然据佛教八识说和精神分析心理学的无意识说而构想。按佛教唯识学，所有疾病，终归为具主管生理活动功能的阿赖耶识所制造，是阿赖耶识这位公正无私的“地下工作者”对储入的有害信息按因果法则进行处理的结果。特别是以细胞恶性增生为实质的癌、恶性肿瘤，病根显然在负责细胞生长的阿赖耶识，只有从这一病根着手，才可能得到根治。 (发布者: 欢迎投稿，网站:无量光佛教网，讨论请进入:佛教论坛)