道光年间（1821-1850），“寺僧之老者弱者，住持者过客者140余人，忽一日尽死”。后经勘查为误食后园毒蕈所致，而寒山寺由此亦废（见薛福成《庸庵笔记》）。

咸丰四年（1854），内阁中书赵文麟、前广东盐运使司运同周曾毓等，捐置寺旁隙地，起造楼房二进计28间，招租收息，作为寒山寺香火。并立寒山寺香产界址（见《署理苏州府知府平翰给示碑》）。

咸丰十年（1860）寺为清军纵火焚烧，一夕之间，化为灰烬。

光绪三十二年（1906）陈夔龙巡抚江苏时，偶因校阅营伍前来枫桥，因见千年古刹寒山寺一片荒芜，乃发心修建：“爰卜日鸠工，展拓其门闾，使临大路。由门而进，折而南行，构堂三楹，由堂而进，东西之屋各三。东屋宏敞，宾朋之所燕息也。西屋稍閷，则凡寺中旧碑，咸植于是。以文待诏所书张懿孙诗，今已残缺，属予补书而重刻焉。堂之西（今注：实为堂之东）尚有隙地，乃构重屋，是曰钟楼。铸铜（实为铜铁合铸）为钟，悬之其上，以存古迹”（见俞樾《新修寒山寺记》）。

宣统二年（1910）程德全巡抚江苏，偕同布政使陆钟琦等，又拓而新之，重建大殿，前为御碑亭（御碑亭位于山门外）。后有楼三楹，可眺远，长廊精舍，“几为吴下精蓝之冠”（见邹福保《重修寒山寺记》）。程德全除新建大殿、后楼、长廊外，书刻《雍正寒山诗序》、乾隆《霜钟晓月》诗碑（即御碑），又书刻寒山诗36首、韦应物以次诗十数首、罗聘绘寒山拾得像、郑文焯绘寒山子像、程德全、陆钟琦、邹福保“三记”，及“妙利宗风”、“寒山寺”门匾等。

寒山寺经陈、程二抚苦心经营，使金绳宝地，焕然一新。

宣统三年，长洲县吴姓两孀张氏、黄氏因义田涉讼，经开导息讼，并各以二十五亩充寺产（见陆锺琦《寒山寺吴姓捐田始末记》）。

民国时期：

辛亥革命后至1949年，历经军阀混战，哀鸿遍野。寒山寺亦处危境，香烟稀少，门庭冷落，收入无着，住僧星散。1941年秋，高冠吾等曾将原藏经楼略事修葺，易名为霜钟阁。落成时有马起权携《寒山杯渡图》以献，题咏者凡92人，诗词156首（见《艺文》卷）。日军侵占苏州时期，寒山寺殿堂房舍曾一度沦为日军仓库马厩，仅有二三寺僧局处一隅厮守而已，其生活来源，唯赖经营浴室菜馆或卖字卖帖，勉强糊口。

中华人民共和国时期：

1949年人民政权建立，及时由苏州市文管会代管。原住持果丰曾一度回寺，终因生活无着，不久又复离去。

1954年原常州接待寺僧演林至寺协助照管香火，寒山寺才又有僧人。同年有苏州名士宋鸿钊者，将其祖传名楼花篮楼施赠寒山寺，移建于碑廊西南隙地，易名为“枫江楼”，使一代名楼得以保存，寒山寺添一景观。

1958年全市寺庙集中管理，部分法像被集中到西园戒幢律寺。隆庆寺龙藏经被调入寒山寺。

1964年市佛教协会派性空到寺协助管理。

1966-1976年“文化大革命”期间，寒山寺一度成为造反派刑讯逼供之牢房，甚至有被拷打至死者。佛像、法器、殿阁受损，寺藏文物被查抄。性空事先采取保护措施，使碑刻、藏经、罗汉等得以保存。

1968年性空被迫下放昆山农村劳动。1970年仅剩的演林，亦被逐出山门，撵往如皋农村劳动。

1976年秋粉碎“四人帮”后，各地纷纷落实政策，拨乱反正。1978年11月15日，全国政协副主席、中国佛教协会会长赵朴初，第一次专程至寒山寺视察并指导修复工作。同年11月17日寒山寺僧净持、性空、果丰、法忍四人，身着僧装，按照中国佛教仪轨，隆重接待以前田洪范为团长的“日本社会教育友好访华团”一行僧尼17人。寒山寺由此开始修复。1979年中共十一届三中全会后，来中国访问的人数不断增加。净持、性空先后接待过美国女记者、联邦德国园艺家、作家等外宾，他们代表西方知识界表示希望了解中国宗教现状。同年7月，市人民政府民族宗教处正式恢复活动，及时召开宗教界人士会议，认真研究落实宗教政策的一系列具体措施。并在会上宣布由政府拨款，加速寒山寺整修工程。同年，从西园寺请回释迦、迦叶、阿难、弥勒、韦陀及寒山、拾得诸塑像。

1979年除夕，在苏州市对外友协倡导配合下，举办第一届寒山寺听钟声活动，参加对象为日本友人120人。为促进中日友好，发展旅游事业开创了一种新形式。此后人数、规模逐年扩大，已成为一年一度的传统节日活动，颇有影响（详《联谊》卷）。

1980年被批准为首批全国重点开放寺院之一。寒山寺再次成为苏州地区旅游热点，修复工程继续紧张进行。因寺貌初有改观，当年就接待国内外游人47万人次（其中海外游人4万人次），门票加上其他收入达10多万元，寒山寺从此收入盈余。

1981年，净持因工作需要调回灵岩山寺，通如回寺任住持。新建心净楼、钟房。中央电视台特派记者为寒山寺古钟和钟楼录相。

1982年省人民政府正式宣布寒山寺为省级文物保护单位。 (发布者: 欢迎投稿，网站:无量光佛教网，讨论请进入:佛教论坛)