从行矩之言，可以明显看出，佛教认为《药师经》是「致福消灾」的要法；药师十二大愿、东方琉璃净土是其果德的彰显，而修持供药师法则是「消百怪」、「除九横」的妙方。因此在整本经文之中，关于信仰功德的部分就占了《药师经》的一大半篇幅，可见药师法门所宣扬的重点即是消灾致福，现世得利益福报。