玄奘得到诏令，便返回京师。随即召请沙门慧明、灵润等人担任证义；沙门行友、玄赜等人担任编辑；沙门智证、辩机等人担任录文；沙门玄模担任核证梵语；沙门玄应来确定字体的伪正。这一年五月开始翻译《大菩萨藏经》二十卷，同时又翻译《显扬圣教论》二十卷，接着又翻译《大乘对法论》十五卷。在翻译期间，稍微有些空隙，玄奘又写出《大唐西域记》十二卷，沙门辩机听玄奘讲述在西域游学的经历，并按时间先后对史料进行了编排。玄奘同时又翻译《佛地经》、《六门神咒》等经，总计有八十卷左右。

    自从佛教传入中国以来，汉地所翻译的佛教经典，都是先根据译师诵出的梵语，记录成梵文经典，再按照汉语的习惯翻译为汉文，这样就无法保证翻译的准确性。而如今所翻译的经典，都是根据玄奘的意旨，经文的意思由玄奘一人决断，玄奘出语成章，记录文词的人将玄奘的译语记录下来，其他人就可以阅读玩赏。因此，玄奘所译的经典就超过了孙吴汉魏所译经典的水平。

    贞观二十二年(648)，皇帝来到玉华宫看望玄奘，问道：“法师最近翻译什么经论？”玄奘回答说：“正在翻译《瑜伽师地论》。”

    皇上又问：“此论是哪位圣人所作？讲的是什么义理？”玄奘对皇帝的提问全都回答后，皇上令将论取来，自己要亲自阅读。接着便颁下诏书，新翻译的经论要抄写九个本子，颁发给雍州、洛州等九个大州。玄奘又请皇帝为经论题序，皇上于是撰写了序文，名叫《大唐三藏圣教序》，令弘文馆学士上官仪对着君臣宣读。

    后来，玄奘随皇帝来到京城，住在弘法院。皇帝又令玄奘住进为文德皇后建造的慈恩寺里，并剃度三百人为僧，同时在慈恩寺西北建造翻经院。高宗李治继位后，对玄奘更是礼遇有加。

    玄奘生平以来，希望往生弥勒佛处。多次祈请，都有明显的验证。麟德元年(664)，玄奘告诉译经的僧人和自己的弟子说：“我已六十五岁了，必然要死在玉华寺，你们对经论有什么疑问，赶快提出来。”说完就卧床不起。这时他不论开眼闭眼，都能看见鲜白的大莲花来到眼前，又看见很高大的佛像。玄奘知道自己要往生佛，就命僧人宣读自己所翻译的经论名目，听到共有七十三部一千三百三十卷后，脸上露出欣慰的笑容。

    玄奘去世后，皇帝下敕书下葬那天允许京城的僧尼用幢盖前往送葬。于是素盖素幢飘浮在空中与白云相合，悲哀的笳声、梵呗声响彻云霄。玄奘先被葬在白鹿原，不久，皇上降旨改葬樊川。当玄奘的遗体从坟茔中取出时，面色如生。

    在玄奘所游历的一百三十个国家中，不论僧徒或俗士、外道或正教，没有人不敬仰他、归依他。