十月十五日下午五点左右，本玄法师在念佛声中由双跏趺改为吉祥半卧，念佛声渐渐没有了，摸不来脉象，大家认为本玄法师已往生，开始轮班助念。到晚上八点竟然醒过来，并说口干要喝水。本玄法师透露∶「前世在兜率宫罗汉内院修行，有三件宝物，其中一件为一口宝刀，现仍在罗汉内院树上挂着哪。」到了十八日，信众云集，本玄法师精神焕发说∶「我今天不去，二十一日走。」并随机开示∶「啥都是空的，抓紧念佛。」、「修行人一定要重视楞严咒，要持楞严咒。」、「念佛人能不能成就，能不能往生，戒律很重要。我一生童子身修行，淫戒不敢大意。」并对普堂居士等人说∶「我临终如果是吉祥卧就火化后入塔，如坐着往生就全身入塔。」并嘱咐∶「将塔建在几十年来亲自栽植的松柏林中。」

　　二十一日清晨，本玄法师照常坐在炕头上早课，一直念佛到上午十一点，喝了一点水。师右侧卧休息一阵后，突然要普堂居士扶他一把，坐起双跏趺后，说他要走了，最后一次开示∶「啥都是空的，还忙什么？好好念佛。」并大声念南无阿弥陀佛五声，观世音菩萨、大势至菩萨数十声，并念净三业真言数遍，声音逐渐变小，上午十一点整圆寂。房中檀香味持续六昼夜，有的居士看到师头顶有光瑞像。二十六日下午，众人将师肉身入龛，当时腿、臂、手部仍柔软如生前。农历十一月初一任扶善居士等人去瞻礼法相时，本玄法师坐姿未变，肤色与生前无异，右手掌部绕着两圈极小的菩提念珠，与左手结成弥陀定印。在手背部近虎口处有豆大的两个小红点，问过在场居士，这是二十二日用湿毛巾擦尘垢出现的。本玄法师头部略向前垂，面部慈祥安泰犹如定中，让众人钦敬不已。

　　农历十一月十七日，是阿弥陀佛圣诞吉日，武山、甘谷四众弟子两百多人以及普通信众、远近村民共约六百馀人举行往生普佛回向追思法会，并予以录影、摄影，以便广为流传。凡临法会者均瞻礼本玄法师德像，见者无不赞叹、敬仰。