此时只见一条长数公里的巨龙出现，头角峥嵘，神光显焕的在云层中翻滚。而前来捉拿普庵禅师的军队见此景像皆惊吓震撼不已，后来带头的巡检官跪地哀求忏悔，由是龙潜雨止。于是忽大队人马又搬师回总督府，巡检官向总督大人报告说：“普庵禅师乃是圣僧，非妖僧也。”

上述的真实故事是表达了什么呢？就是一位戒行、内修、证量都圆满的佛教大成就者，在人间弘法时，一定有龙天护法护佑的。

又有一次信众陈天章员外出钱举办一次水陆大斋法会，并恭请普庵禅师及佛寺中的比丘为其祖先诵经超度。而普庵师父领为陈家诵了一部金刚经（诵一遍），这时陈员外心中滴滴咕咕的很不满意的说：“怎么只诵一遍金刚经呢？太少了吧！”。而普庵曰：“尔既不满意，再为尔还。”又集众诵金刚经一遍，可是陈天章回家后心中还是很不满意。

忽然有一天陈员外暴毙而亡，三日后又复苏，陈员外自言道：“我死后魂就被带到地府幽冥，而地府判官很不客气的告诉我说：‘汝在生时不信因果，不识生佛，施财入大慈化寺建雨中水陆，负一中经债。合与铁枷治罪。’这时陈员外在地府中向冥官深深忏悔，而幽冥便放他回阳。”所以三日后又活过来了。随后陈员外带全家子子孙孙与五百两银钱，来到大慈化寺准备向普庵师父请罪，而普庵问曰：“昔作善因如何？”陈员外很恭敬的礼拜说：“凡眼不识生佛，起不信心。望慈悲赦罪。”

从上述故事中可知一位德行兼备、内修圆满的佛教修行者，其诵一部金刚经即超度祖先的功德是不可思议的。现今许多修密宗者，学了一大堆咒语，也修些仪轨就以为自己即身成佛了，其实不然。真正要主法修持而达到法施利益鬼魂、业障、宿世怨亲者，还是要依仗三宝的力量（当然不能请破戒比丘或魔众比丘来施法，否则亦无法利益十方众生），就好比前面提到的普庵禅师与悟明长老超度冤胡魂祖先的实际故事，就是最好的见证了。

师有《普庵印肃禅师语录》三卷行世。付法有圆通、圆融、圆成、圆信、应世等人。此外，师所传之〈普庵咒〉在后世禅宗寺院及民间颇为流传。除课诵之外，该咒亦被谱成古琴曲与琵琶曲。